Selon le porte-parole de la Marine argentine Enrique Balbi, l'équipage du sous-marin a détecté une voie d'eau qui a endommagé le bloc moteur.
L'eau s'est infiltrée dans le compartiment des batteries par le système de ventilation. Elle a provoqué un court-circuit qui a lui-même entraîné un début d'incendie rapidement maîtrisé.
Récemment, le journal argentin la Nación a écrit que l'achat de batteries pour le sous-marin disparu avait été réalisé en contravention avec les règlements, selon une enquête menée il y a deux ans par le ministère argentin de la Défense.
Le 15 novembre, le commandement de la Marine argentine a perdu le contact avec le sous-marin argentin ARA San Juan. Il avait quitté le port d'Ushuaia avant de mettre le cap sur Mar del Plata, à 400 kilomètres au sud de Buenos Aires. La Marine argentine a plus tard fait savoir qu'une explosion avait été enregistrée qui pourrait être liée à la disparition du sous-marin.
