Le Pentagone a dressé une liste des déficiences techniques du chasseur F-35, projet le plus onéreux de l'histoire de l'armée US qui fait l'objet d'intenses critiques de la part des experts militaires.
Selon un rapport publié par le Bureau d'Essais et d’Evaluation Opérationnelle du Pentagone, le logiciel du Block 2B de l'avion, responsable de ses capacités de combat, présente des problèmes liés à la navigation et à la précision des attaques, ce qui ralentit la performance du chasseur.
Le F-35 a été doté d'un nouveau système de réservoirs de carburant, le système précédent menaçant de générer des fuites de gaz potentiellement explosives. Cependant, les essais du système modernisé ont mis en lumière des problèmes d'intégration nécessitant de nouvelles modifications sur le plan technique et informatique.
Au cours de l'exploitation du chasseur, une détérioration de la commande a sérieusement compliqué les attaques menées sous certains angles dans des conditions de combat intenses.
Dans le même temps, des défaillances sont régulièrement détectées dans l’épine dorsale informatique du F-35, ALIS (Automatic Logistics Information System), sorte de système d'exploitation qui compte plus de 30 millions de lignes de code. Ce logiciel est censé fournir des informations sur l'état de l'avion tant aux pilotes qu'au personnel au sol.