Le taux de mortalité dû au VIH et au SIDA a également diminué: aujourd'hui, 46,5 personnes sur 100.000 personnes meurent de ces maladies, soit 64,5% de moins qu'en 2003. Les taux les plus élevés ont été enregistrés au Lesotho, à Eswatini et au Botswana.
L'amélioration du diagnostic et du traitement a contribué à la réduction du nombre d’infections au VIH dans la région, selon l’étude.