Auparavant, M.Fanning exerçait les fonctions de sous-secrétaire de l'Armée. Il est considéré comme un conseiller proche de l'actuel chef du Pentagone Ashton Carter.
Ce dernier a précédemment qualifié la nomination de Fanning par le président Barack Obama d'"excellent choix".
"Eric a servi comme mon premier chef du personnel au Pentagone, et ça a été un privilège de travailler avec lui et le voir s'affirmer comme l'un des fonctionnaires les plus compétents, dévoués et expérimentés de notre pays", a déclaré M.Carter dans un communiqué.
A la fin des années 2000, Eric Fanning a notamment fait partie du conseil d'administration du Gay & Lesbian Victory Fund, organisation qui milite pour augmenter le nombre de personnes LGBT à "tous les niveaux de gouvernement".
La loi de compromis dite "Don't ask, don't tell" (Ne rien demander, ne rien dire) obligeait les gays et lesbiennes de l'armée à ne pas afficher leurs préférences sexuelles sous peine d'être renvoyés.