En 2009, la chaîne de télévision ABC, se référant à des sources officielles en Lituanie, a dévoilé la présence d'un site géré par la CIA dans une banlieue de Vilnius qui abritait, avant sa fermeture, huit personnes.
CIA’s secret black sites @edmund_clark and Crofton Black https://t.co/0E7fXSn17v @FTMag @FlowersGallery @aperturefnd pic.twitter.com/DUXJlvFYNm
— Emma Bowkett (@emmalbowkett) 18 марта 2016 г.
Cependant, en 2011, l'ex-président lituanien Valdas Adamkus (2004-2009), interrogé sur des rapports faisant état de la présence de détenus de la CIA dans son pays, a déclaré qu'il n'existait aucune preuve de la véracité de ces informations.
Selon le FT, les établissements en question étaient situés en Lituanie, en Afghanistan, en Macédoine, en Italie, en Libye et en Roumanie.
En 2015, le parquet général de Lituanie a repris le dossier sur une prison secrète de la CIA dans le pays, fermé en 2011.
Depuis 2008, le parquet polonais mène l'affaire d'une prison de la CIA sur le territoire du pays. En 2014, la Cour européenne des droits de l'homme (CEDH) a condamné la Pologne à payer 100.000 euros à deux ex-détenus de la prison polonaise de la CIA.