La possibilité d’utiliser des scanners était également incluse dans les versions précédentes, mais les pilotes et le logiciel de l'appareil étaient fournis par une société tierce. Windows 8.1 reconnaîtra les scanners sans logiciels supplémentaires.
Dans l’avenir, l'utilisateur pourra lier son compte Microsoft avec les empreintes digitales. Cela permettra à l’utilisateur d’entrer dans le système, s’identifier dans les applications et confirmer l’achat des programmes en posant son doigt sur le scanner. En outre, il sera possible de protéger les dossiers personnels avec les empreintes.