Les négociations, qui se sont déroulées à Juba, ont réuni le vice-président de la région semi-autonome du Sud-Soudan Riek Machar et le vice-président soudanais Ali Osmane Taha.
"Nous avons surmonté les divergences sur les questions principales et avons désormais un accord que nous soumettrons à nos présidents pour approbation", a déclaré M.Machar à l'issue des négociations.
Il a fait savoir qu'aux termes des ententes intervenues entre les parties, le référendum ne serait valide que si la participation totalise au moins les deux tiers des électeurs. L'indépendance sera accordée si cette option réunit 50% plus une voix.
L'organisation d'un référendum sur l'indépendance du Sud-Soudan a constitué l'une des conditions clés de l'accord de paix conclu en 2005. Cet accord a mis un terme aux 22 ans de guerre qui a fait plus de deux millions de morts dans le sud du pays.
L'accord sur le référendum doit désormais être approuvé par les leaders du Soudan et de la région semi-autonome du sud.