Il a d'abord visité l'observatoire d'Oulougbek, savant, penseur et protecteur des arts qui gouverna Samarkand en 1424-1428. C'est dans cet observatoire que le petit-fils de Tamerlan créa le premier catalogue astronomique répertoriant les coordonnées de 1.018 étoiles.
Les deux présidents se sont ensuite rendus dans le mausolée du prophète biblique Saint-Daniel, haut-lieu de l'islam, du christianisme et du judaïsme. Ce site abrite également un pistachier vieux de 500 ans. En 1996, le patriarche russe Alexis II, lors d'une visite en Ouzbékistan, est venu bénir cet arbre à moitié mort qui, depuis, s'est remis à fleurir.
MM. Medvedev et Karimov n'ont pas manqué de jeter un coup d'oeil sur le célèbre bazar de Samarkand où, sous les applaudissements de la foule, des marchands ont offert au président russe des fruits et des galettes locales.