Pour cette installation, deux variantes de zone active avec différents types de combustible nucléaire uranium-plutonium sont développées simultanément:
avec du combustible MOX à base d'oxyde mixte d'uranium et de plutonium;
avec du combustible mixte de nitrure d'uranium-plutonium (MNUP).
Les nouveaux assemblages combustible doivent subir un cycle d'essais dans le réacteur BN-600 de la centrale nucléaire de Beloïarsk. Le chargement en zone active est prévu pour 2025.
Le BN-1200 devrait devenir le premier réacteur à neutrons rapides produit en série au monde.