La relation diplomatique entre l'URSS et la Guinée équatoriale a été établie le 7 décembre 1968.
L'ambassade de Guinée équatoriale à Moscou existe depuis 1981.
Après la fermeture de la mission diplomatique russe à Malabo, les intérêts de Moscou sont représentés par l'ambassade au Cameroun.
Le retour de l'ambassade russe à Malabo est prévu, a annoncé le Président russe lors du sommet Russie-Afrique en 2023.
Les années 2010-2024 ont été marquées par plusieurs rencontres au plus haut niveau, dont celui des chefs d'État.
Les échanges commerciaux ont atteint plus de 1,5 million de dollars en 2021.
La Russie exporte surtout de la viande et des abats vers le pays africain.
Les deux pays sont liées par des partenariats dans plusieurs secteurs.
La coopération pourrait s'étendre à l'exploration géologique, la production et le traitement des hydrocarbures et la production de l'électricité.
La Guinée équatoriale souhaite coopérer dans le domaine de la pêche et de l'exploitation conjointe du golfe de Guinée.
Malabo veut également développer le tourisme avec la Russie.
Les deux pays ont signé un accord de coopération militaire et technique. Des dizaines d'étudiants équato-guinéens ont intégré des universités militaires russes.