L'attaque s'est produite mercredi en fin d'après-midi près de la ville de Nara, à environ 30 kilomètres au sud de la frontière avec la Mauritanie.
"Une unité dans la région de Nara a été la cible d'une attaque complexe combinant des engins explosifs improvisés et des armes lourdes", indique le communiqué, ajoutant que le bilan des victimes est provisoire.
Aucun groupe n'a pour l'instant revendiqué l'attaque.
Le Mali, le Niger et le Burkina Faso luttent contre des groupes islamistes armés dans la bande sahélo-saharienne, un conflit qui a fait des milliers de morts et déplacé des millions de personnes malgré les efforts déployés depuis neuf ans par les forces de maintien de la paix internationales, dont les troupes françaises de Barkhane.