Les forces de l'ordre ont recommandé d'éviter les gares de Cergy-le-Haut et Cergy-Saint-Christophe tandis qu'une opération de police s'y déroule. Aux environs de 16h30, la gare a été fermée.
Le trafic a été perturbé entre la gare et Nanterre–Préfecture, ainsi qu'Achères–Ville, Sartrouville, Paris Saint-Lazare et Cergy–Préfecture. La SNCF a fait état d'un incident sur la ligne L du Transilien.
En 2018, la gare a été fermée pour aménager une quatrième voie qui a permis de fluidifier le trafic.
La reprise du RER A avait été initialement annoncée pour 18h00, puis reportée à 18h30. Les services spécialisés de police y ont été déployés.
Après les dernières vérifications de sécurité, le trafic du RER A reprend progressivement.